PHP直接输出html的，可以采用以下的方法进行过滤：
1.htmlspecialchars函数
2.htmlentities函数
3.HTMLPurifier.auto.php插件
4.RemoveXss函数（百度可以查到）
PHP输出到JS代码中，或者开发Json API的，则需要前端在JS中进行过滤：
1.尽量使用innerText(IE)和textContent(Firefox),也就是jQuery的text()来输出文本内容
2.必须要用innerHTML等等函数，则需要做类似php的htmlspecialchars的过滤（参照@eechen的答案）
其它的通用的补充性防御手段 继续阅读“PHP防御XSS攻击的终极解决方案”